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所有不動産記録証明制度は大企業にこそ有効?多数の不動産を保有する法人が得られる大きなメリット

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所有不動産記録証明制度は大企業にこそ有効?多数の不動産を保有する法人が得られる大きなメリット

所有不動産記録証明制度は大企業にこそ有効?多数の不動産を保有する法人が得られる大きなメリット

 令和8年(2026年)2月2日から、「所有不動産記録証明制度」が始まりました。

 この制度は、相続登記の漏れを防ぐための制度として紹介されることが多くあります。亡くなった方がどこに不動産を持っていたか分からない場合に、法務局で被相続人名義の不動産を一覧的に確認できる制度、という説明です。

 もちろん、相続手続きにおいて非常に重要な制度であることは間違いありません。

 しかし、所有不動産記録証明制度の価値は、相続の場面だけに限られません。

 実は、多数の不動産を保有する法人、特に全国に店舗、営業所、工場、倉庫、社宅、物流施設、インフラ施設、遊休地などを持つ大企業にとって、この制度は非常に大きな意味を持ちます。

 東洋経済オンラインの記事でも、上場企業の中には土地を極めて大きな規模で保有している企業があることが紹介されています。

東洋経済オンライン「首位は3兆円超、『土地持ち企業』300社ランキング」

 不動産大手、鉄道会社、インフラ企業、メーカー、小売業、金融機関などは、長年の事業活動の中で多くの不動産を取得しています。

 その一方で、会社の本店移転、商号変更、吸収合併、会社分割、事業譲渡、グループ再編などが繰り返されると、社内の固定資産台帳と不動産登記簿の情報が一致しなくなることがあります。

 特に、吸収合併が行われた場合、消滅会社名義の不動産が登記簿上残っていることがあります。社内では当然に承継したものとして管理していても、登記簿上は旧会社名義のまま、旧本店所在地のまま、ということは珍しくありません。

 このような状態は、普段の業務では見えにくい問題です。

 しかし、不動産を売却する、担保に入れる、再開発する、M&Aのデューデリジェンスを受ける、固定資産を棚卸しする、内部統制上の確認を行う、といった場面では大きな問題になります。

 この記事では、所有不動産記録証明制度を、多数の不動産を保有する大企業がどのように活用できるのか、特に吸収合併があった場合の検索条件の組み立て方、履歴事項証明書・閉鎖事項証明書などの添付書類の考え方まで踏み込んで解説します。

所有不動産記録証明制度とは

 所有不動産記録証明制度とは、特定の人または法人が、登記簿上、所有権の登記名義人として記録されている不動産を、法務局が検索し、一覧的に証明する制度です。

 従来の不動産登記制度は、不動産ごとに登記記録が作成されています。土地であれば一筆ごと、建物であれば一個の建物ごとに登記記録が存在します。

 そのため、所在、地番、家屋番号が分かっていれば、その不動産の登記事項証明書を取得して所有者を確認することができます。

 しかし、反対に「ある法人が全国にどの不動産を持っているのか」を一括して確認することは、これまで簡単ではありませんでした。

 所有不動産記録証明制度は、この問題を解決するための制度です。

 法人自身が、自社名義の不動産を確認するために利用することができます。また、吸収合併などにより不動産を承継した法人が、承継関係を示したうえで、旧会社名義の不動産を確認する場面でも活用が考えられます。

法務省「所有不動産記録証明制度について」

大企業にとっての本当の価値

 所有不動産記録証明制度は、個人の相続だけでなく、大企業の不動産管理において非常に大きな価値があります。

 大企業では、不動産が全国に点在していることがあります。

 たとえば、次のような不動産です。

① 本社ビル、支社、支店、営業所
② 工場、研究所、物流倉庫、配送センター
③ 店舗、駐車場、ショッピングセンター用地
④ 鉄道用地、送電線敷地、通信施設用地、ガス施設用地
⑤ 社宅、寮、保養所、研修施設
⑥ 遊休地、旧工場跡地、旧店舗跡地
⑦ 私道持分、共有持分、通路部分、排水施設用地

 これらの不動産は、取得時期も、取得原因も、所在地も、管理部門も異なります。

 さらに、長い年月の中で、会社の商号が変わったり、本店が移転したり、グループ会社を吸収合併したり、事業を譲り受けたりすることがあります。

 その結果、登記簿上の所有者情報が、現在の会社情報と一致しなくなることがあります。

 社内の固定資産台帳には現在の会社名で登録されているが、登記簿上は旧商号のまま。会計上は承継済みの不動産として扱われているが、登記簿上は吸収合併で消滅した会社名義のまま。こうした不一致は、大企業ほど発生しやすい問題です。

 所有不動産記録証明制度は、こうした「登記簿上、誰の名義で残っているのか」を確認する入口になります。

吸収合併があると不動産管理は一気に複雑になります

 法人の不動産管理で特に注意が必要なのが、吸収合併です。

 吸収合併では、消滅会社の権利義務を存続会社が承継します。不動産も、法律上は存続会社に承継されます。

 しかし、不動産登記簿の名義が自動的にすべて書き換わるわけではありません。

 そのため、消滅会社が所有していた不動産について、登記簿上の所有者が消滅会社のまま残っていることがあります。

 たとえば、次のようなケースです。

平成10年 A株式会社が東京都内に工場用地を取得

平成20年 A株式会社が本店を大阪市から東京都港区へ移転

平成28年 A株式会社がB株式会社に吸収合併されて解散

令和8年 B株式会社が自社所有不動産の棚卸しを開始

 この場合、社内では「A株式会社の資産はB株式会社が承継済み」と整理されているかもしれません。

 しかし、登記簿を確認すると、所有者欄にはまだ「A株式会社」と記録されていることがあります。

 さらに、住所も古い本店所在地のままになっている可能性があります。

 このような不動産は、現在のB株式会社の名称と本店所在地だけで検索しても、所有不動産記録証明書に出てこない可能性があります。

 つまり、吸収合併があった法人では、現在の会社名だけで検索しても不十分です。

検索条件の考え方

 所有不動産記録証明制度を利用する際に最も重要なのは、検索条件です。

 所有不動産記録証明書は、請求書に記載した検索条件に基づいて作成されます。

 法人の場合、検索条件として重要になるのは、主に次の情報です。

① 法人の名称
② 本店又は主たる事務所の所在地
③ 会社法人等番号
④ 旧商号
⑤ 旧本店所在地
⑥ 吸収合併で消滅した会社の名称
⑦ 消滅会社の旧本店所在地
⑧ 合併前後の会社法人等番号

 検索条件は、「現在の会社名と現在の本店所在地」だけでは足りないことがあります。

 特に、過去に本店移転、商号変更、吸収合併、組織変更、管轄外本店移転などがある法人では、旧情報を含めて検索条件を組み立てる必要があります。

 1つの検索条件欄に複数の名称や住所をまとめて記載するのではなく、名称と住所の組み合わせごとに検索条件を分けて整理することが重要です。

吸収合併があった場合の検索条件例

 吸収合併があった場合には、存続会社だけでなく、消滅会社についても検索条件を検討する必要があります。

 たとえば、次のような会社を想定します。

存続会社 B株式会社

現在本店 東京都千代田区〇〇一丁目1番1号

旧本店  東京都港区〇〇二丁目2番2号

消滅会社 A株式会社

A社旧本店 大阪市北区〇〇三丁目3番3号

A社最終本店 東京都港区〇〇二丁目2番2号

 このような場合、検索条件としては、少なくとも次のような組み合わせを検討します。

① B株式会社 東京都千代田区〇〇一丁目1番1号
② B株式会社 東京都港区〇〇二丁目2番2号
③ A株式会社 東京都港区〇〇二丁目2番2号
④ A株式会社 大阪市北区〇〇三丁目3番3号

 なぜここまで検索条件を分ける必要があるのでしょうか。

 それは、不動産登記簿上の所有者表示が、不動産を取得した当時の名称・住所のまま残っていることがあるからです。

 A株式会社が大阪市に本店を置いていた時代に取得した不動産であれば、登記簿上は「A株式会社 大阪市北区〇〇三丁目3番3号」と記録されている可能性があります。

 その後、A株式会社が本店を東京都港区へ移転していても、不動産登記簿上の住所変更登記をしていなければ、大阪市の住所のままです。

 さらに、A株式会社がB株式会社に吸収合併されても、合併による所有権移転登記をしていなければ、不動産登記簿上はA株式会社名義のままです。

 したがって、現在のB株式会社の名称と本店所在地だけを検索条件にしても、旧A株式会社名義の不動産は抽出されない可能性があります。

履歴事項証明書・閉鎖事項証明書の重要性

 吸収合併があった法人が所有不動産記録証明制度を利用する場合、検索条件を正確に組み立てるために、商業登記の履歴を確認する必要があります。

 具体的には、次のような書類を確認します。

① 存続会社の履歴事項全部証明書
② 存続会社の閉鎖事項全部証明書
③ 消滅会社の履歴事項全部証明書
④ 消滅会社の閉鎖事項全部証明書
⑤ 合併の記載がある登記事項証明書
⑥ 本店移転、商号変更、組織変更の履歴が分かる証明書

 履歴事項全部証明書には、現在効力を有する事項と、一定期間内の変更履歴が記載されます。

 しかし、古い本店移転や商号変更、閉鎖された登記記録に記載されている事項は、履歴事項全部証明書だけでは確認できないことがあります。

 その場合には、閉鎖事項全部証明書や閉鎖登記簿謄本を取得して、過去の名称・本店所在地・会社法人等番号の変遷を確認する必要があります。

 特に、古い時期の組織変更や管轄外本店移転がある場合、現在の会社法人等番号だけでは、過去の登記記録とのつながりを十分に確認できないことがあります。

 所有不動産記録証明制度の請求においても、承継関係や変更の経緯を説明するため、履歴事項全部証明書、閉鎖事項全部証明書、会社法人等番号などを整理しておくことが重要です。

添付書類の考え方

 所有不動産記録証明書を法人が請求する場合、法人の代表者が請求するのか、司法書士などの代理人が請求するのかによって、必要書類の整理が変わります。

 また、現在の法人名義の不動産を調べるのか、吸収合併により承継した消滅会社名義の不動産を調べるのかによっても、添付書類の考え方が変わります。

 実務上、確認・準備を検討すべき資料は次のとおりです。

① 請求人法人の履歴事項全部証明書

 現在の法人の名称、本店所在地、代表者、会社法人等番号を確認するための資料です。

② 請求人法人の印鑑証明書

 請求書や委任状に実印を押印する場合に必要となることがあります。

③ 委任状

 司法書士などの代理人が請求する場合に必要です。法人の実印を押印し、印鑑証明書を添付する運用が想定されます。

④ 吸収合併を証する登記事項証明書

 存続会社が消滅会社の権利義務を承継したことを示すために、合併の記載がある履歴事項全部証明書又は閉鎖事項全部証明書を確認します。

⑤ 消滅会社の閉鎖事項全部証明書

 消滅会社の旧商号、旧本店所在地、会社法人等番号、合併による解散の事実を確認するために重要です。

⑥ 旧本店所在地や旧商号を証する資料

 検索条件に旧本店所在地や旧商号を含める場合、その根拠資料として履歴事項証明書や閉鎖事項証明書を整理します。

 最終的にどの書類が必要となるかは、請求の内容、検索条件、法人の沿革、法務局の確認事項によって異なります。

 そのため、大企業のように合併や本店移転の履歴が多い場合には、請求前に商業登記の履歴を整理し、どの検索条件をどの資料で説明できるかを確認しておくことが大切です。

検索条件を誤ると不動産が出てこない

 所有不動産記録証明制度は便利な制度ですが、万能ではありません。

 最も注意すべき点は、検索条件が不十分だと、本来抽出されるべき不動産が証明書に出てこない可能性があることです。

 たとえば、次のような場合です。

① 現在の会社名だけで検索し、旧商号を検索していない
② 現在の本店所在地だけで検索し、旧本店所在地を検索していない
③ 吸収合併後の存続会社名だけで検索し、消滅会社名を検索していない
④ 消滅会社の最終本店だけで検索し、さらに古い旧本店所在地を検索していない
⑤ 会社法人等番号の変更履歴を確認していない
⑥ 閉鎖事項証明書を確認せず、古い商号・本店所在地を見落としている

 大企業では、数十年前に取得した不動産が、当時の会社名・当時の本店所在地のまま登記されていることがあります。

 そのため、現在の会社情報だけで検索すると、「証明書に出てこないから不動産は存在しない」と誤解してしまうおそれがあります。

 所有不動産記録証明制度を大企業が利用する場合には、単に証明書を請求するのではなく、検索条件の設計が最も重要です。

大企業で想定される検索条件リストの作り方

 多数の不動産を保有する企業では、所有不動産記録証明書を請求する前に、検索条件リストを作成することをおすすめします。

 検索条件リストには、次の項目を整理します。

① 検索対象法人の名称
② 検索対象法人の旧商号
③ 検索対象法人の本店所在地
④ 検索対象法人の旧本店所在地
⑤ 会社法人等番号
⑥ 会社法人等番号が変更された履歴
⑦ 吸収合併の年月日
⑧ 消滅会社名
⑨ 消滅会社の旧商号
⑩ 消滅会社の本店所在地・旧本店所在地
⑪ 各検索条件の根拠資料

 たとえば、次のような表を社内で作成します。

番号 名称 住所・本店所在地 区分 根拠資料
1 B株式会社 東京都千代田区〇〇一丁目1番1号 現在商号・現在本店 履歴事項全部証明書
2 B株式会社 東京都港区〇〇二丁目2番2号 現在商号・旧本店 履歴事項全部証明書
3 A株式会社 東京都港区〇〇二丁目2番2号 消滅会社・最終本店 閉鎖事項全部証明書
4 A株式会社 大阪市北区〇〇三丁目3番3号 消滅会社・旧本店 閉鎖事項全部証明書

 このように整理しておくと、請求時の検索条件を漏れなく検討しやすくなります。

 また、証明書の取得後に、どの検索条件からどの不動産が抽出されたのかを社内で管理しやすくなります。

所有不動産記録証明制度と固定資産台帳の突合

 大企業が所有不動産記録証明制度を利用する最大のメリットは、社内台帳と登記情報を突合できることです。

 多くの企業では、固定資産台帳、管財部門の不動産台帳、経理部門の資産管理資料、事業部門の現場管理資料など、複数の台帳が存在します。

 しかし、それらの台帳と不動産登記簿が完全に一致しているとは限りません。

 所有不動産記録証明書によって抽出された不動産と、社内の固定資産台帳を照合することで、次のような問題を発見できる可能性があります。

① 社内台帳にはあるが、登記簿上の名義が旧会社のままになっている不動産
② 登記簿上は会社名義だが、社内台帳で十分に管理されていない不動産
③ 吸収合併で承継したが、登記名義変更が未了の不動産
④ 売却済みと思っていたが、登記簿上は名義が残っている不動産
⑤ 私道持分や共有持分など、現場では把握されにくい不動産
⑥ 担保権、地上権、地役権などが残っている不動産

 これは、単なる登記手続きではなく、企業の資産管理、内部統制、リスク管理の問題です。

M&A・企業再編でのメリット

 所有不動産記録証明制度は、M&Aや企業再編の場面でも大きなメリットがあります。

 会社を買収する場合、買主側は対象会社がどのような不動産を保有しているかを確認します。

 通常は、固定資産台帳、登記事項証明書、売買契約書、賃貸借契約書、担保資料などを確認します。

 しかし、対象会社が過去に吸収合併をしている場合、固定資産台帳に記載されている情報だけでは不十分なことがあります。

 消滅会社名義の不動産が残っている可能性があるからです。

 所有不動産記録証明制度を利用すれば、現在の対象会社名義だけでなく、旧商号、旧本店所在地、消滅会社名義の検索条件を設定することで、登記簿上残っている不動産を確認する手がかりになります。

 これは、M&Aのデューデリジェンスにおいて非常に有用です。

 買収後に「登記簿上、旧会社名義の土地が残っていた」「簿外の不動産があった」「担保権や地役権が残っていた」という事態を避けるためにも、登記情報の棚卸しは重要です。

担保設定・売却・再開発でのメリット

 不動産を売却する場合や、金融機関の担保に提供する場合、登記簿上の所有者表示が現在の会社情報と一致している必要があります。

 たとえば、売主がB株式会社であるにもかかわらず、登記簿上の所有者が吸収合併で消滅したA株式会社のままであれば、売買による所有権移転登記の前提として、合併による所有権移転登記や名義整理が必要になります。

 同様に、抵当権設定登記や根抵当権設定登記を行う場合にも、所有者表示や権利承継関係を確認する必要があります。

 これが取引直前に判明すると、売買決済や融資実行のスケジュールに影響することがあります。

 大企業の場合、1件の不動産取引でも、対象物件が多数筆に及ぶことがあります。さらに、私道持分や共有持分、建物、敷地権、地上権、地役権などが関係することもあります。

 事前に所有不動産記録証明制度を活用し、登記簿上の名義を棚卸ししておくことで、取引直前の混乱を防ぎやすくなります。

スマート変更登記との組み合わせ

 所有不動産記録証明制度は、スマート変更登記とも相性のよい制度です。

 令和8年(2026年)4月1日から、住所・氏名・名称等の変更登記が義務化されました。

 法人の場合、本店移転や商号変更があったときには、所有権の登記名義人の表示変更登記が問題になります。

 多数の不動産を保有する企業にとって、本店移転や商号変更のたびに、全国の不動産について変更登記を行う負担は大きなものです。

 スマート変更登記や法人識別事項の整備により、将来の変更登記の負担軽減が期待されます。

 しかし、その前提として、自社が登記簿上どの不動産の所有者として記録されているかを把握していなければなりません。

 そこで、所有不動産記録証明制度による不動産の洗い出しが重要になります。

法務省「住所等変更登記の義務化特設ページ」

法務省「所有権の登記名義人による法人識別事項の申出について」

実務上の進め方

 大企業が所有不動産記録証明制度を活用する場合、次のような流れで進めると整理しやすくなります。

① 対象法人の沿革を整理する

 現在の会社だけでなく、旧商号、旧本店所在地、吸収合併した会社、会社分割で承継した事業などを整理します。

② 履歴事項証明書・閉鎖事項証明書を取得する

 現在の法人、旧法人、消滅会社について、商号変更、本店移転、合併、解散の履歴を確認します。

③ 検索条件リストを作成する

 名称と住所の組み合わせを1件ずつ整理し、どの証明書を根拠にその検索条件を設定するのかを明確にします。

④ 所有不動産記録証明書を請求する

 検索条件に基づき、法務局へ請求します。代理人に委任する場合は、委任状や印鑑証明書などを準備します。

⑤ 抽出された不動産の登記事項証明書を取得する

 一覧に記載された不動産について、現在の権利関係、所有者表示、担保権、共有者、地役権などを確認します。

⑥ 社内台帳と突合する

 固定資産台帳、管財台帳、現場管理資料、会計資料と照合し、不一致や未整理物件を洗い出します。

⑦ 必要な登記を実施する

 合併による所有権移転登記、名称変更登記、住所変更登記、担保権抹消登記、法人識別事項の申出など、必要な手続きを整理して実施します。

不動産の場所を確認することも重要です

 所有不動産記録証明書によって、不動産の所在や地番が分かっても、現地の場所がすぐに分かるとは限りません。

 特に、大企業が保有する不動産には、鉄道用地、送電線敷地、旧工場跡地、山林、原野、農地、私道持分、共有持分など、地番だけでは場所を把握しにくい土地が含まれることがあります。

 不動産管理では、「登記簿上存在すること」と「現地でどこにあるか分かること」は別問題です。

 所有不動産記録証明制度で不動産を洗い出した後は、公図、地積測量図、航空写真、固定資産資料、現地資料などを組み合わせて、実際の場所を確認する必要があります。

相続した土地・登記上の土地の場所を確認する

大企業にとっての絶大なメリット

 所有不動産記録証明制度を大企業が活用するメリットは、単に不動産一覧を取得できることではありません。

 本質的なメリットは、登記簿上の不動産情報を起点に、会社の資産管理を再構築できることです。

 具体的には、次のような効果が期待できます。

① 旧会社名義の不動産を発見できる可能性がある
② 吸収合併後に未整理となっている不動産を確認できる
③ 固定資産台帳と登記簿の不一致を発見できる
④ 売却・担保設定・再開発の前提整理ができる
⑤ M&Aや企業再編のデューデリジェンスに活用できる
⑥ 住所等変更登記義務化への対応を進められる
⑦ スマート変更登記や法人識別事項の整備につなげられる
⑧ 遊休地・低利用地・管理外不動産の把握につながる

 不動産を多数保有する企業にとって、登記簿上の情報は単なる法務資料ではありません。

 企業価値、財務、内部統制、ガバナンス、コンプライアンス、事業戦略に直結する重要な情報です。

 所有不動産記録証明制度は、その情報を整理するための新しい入口になる制度です。

司法書士に相談するメリット

 所有不動産記録証明書の請求自体は、法人自身でも行うことができます。

 しかし、大企業がこの制度を本格的に活用する場合、単に請求書を出すだけでは十分ではありません。

 重要なのは、検索条件の設計です。

 どの法人名で検索するのか。

 どの本店所在地で検索するのか。

 旧商号を含めるべきか。

 消滅会社名義を含めるべきか。

 どの閉鎖事項証明書を確認すべきか。

 会社法人等番号の変更履歴をどう扱うべきか。

 証明書に出てきた不動産について、どの登記を先に行うべきか。

 これらを判断するには、不動産登記と商業登記の双方の知識が必要です。

 司法書士は、不動産登記と商業登記の専門家です。

 特に、吸収合併、本店移転、商号変更、会社分割、担保設定、不動産売却が関係する場合には、商業登記の履歴と不動産登記の名義を一体として確認する必要があります。

 司法書士法人JOネットワークでは、法人の所有不動産調査、所有不動産記録証明制度の活用、吸収合併後の不動産名義整理、住所・名称変更登記、法人識別事項の申出、担保設定・抹消登記などについてご相談を承っています。

まとめ

 所有不動産記録証明制度は、相続登記の漏れを防ぐための制度として始まりました。

 しかし、この制度は、多数の不動産を保有する大企業にとっても非常に大きなメリットがあります。

 特に、吸収合併があった法人では、消滅会社名義の不動産、旧商号の不動産、旧本店所在地のまま残っている不動産が存在する可能性があります。

 現在の会社名と現在の本店所在地だけで検索しても、これらの不動産が抽出されない可能性があります。

 そのため、履歴事項全部証明書、閉鎖事項全部証明書、会社法人等番号、合併の履歴、本店移転の履歴、商号変更の履歴を確認し、検索条件を丁寧に組み立てることが重要です。

 所有不動産記録証明制度を活用して登記簿上の不動産を洗い出し、社内の固定資産台帳と突合し、必要な変更登記・承継登記・法人識別事項の整備を進める。

 この流れを作ることで、大企業の不動産管理は大きく改善できます。

 不動産を多数保有する法人、過去に吸収合併を行った法人、旧会社名義の不動産が残っている可能性がある法人は、所有不動産記録証明制度の活用を検討する価値があります。

関連情報

法務省「所有不動産記録証明制度について」

法務省「所有権の登記名義人による法人識別事項の申出について」

法務省「住所等変更登記の義務化特設ページ」

法務省「不動産登記令等の改正に伴う添付情報の変更に関するQ&A」

東洋経済オンライン「首位は3兆円超、『土地持ち企業』300社ランキング」

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